Таможенные органы проводят таможенный контроль, используя принцип выборочности для обеспечения соблюдения таможенного законодательства Евразийского экономического союза. Также, в ходе осуществления таможенного контроля, таможенные органы используют формы таможенного контроля, установленные таможенным кодексом Евразийского экономического союза. Основной целью таможенного контроля является защита экономических и национальных интересов, а также создание условий для иностранных инвестиций и защита интересов отечественных производителей.