Под правоохранительной деятельностью таможенных органов следует понимать «деятельность уполномоченных должностных лиц ФТС России, реализуемую в целях выявления и пресечения правонарушений и преступлений, относящихся к компетенции таможенных органов». Регулирование данной деятельности осуществляется как в рамках наднационального законодательства, посредством норм, закрепленных в Таможенном кодексе ЕАЭС, так и с помощью норм национального законодательства: Уголовный кодекс, Уголовно-процессуальный кодекс, Кодекс Российской Федерации об Административных правонарушениях и пр.